MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 chromosome

Total Repeats: 108130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019684	ATG	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727290
2	NC_019684	TGT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727290
3	NC_019684	GTT	2	6	414	419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727290
4	NC_019684	TTGG	2	8	457	464	0 %	50 %	50 %	0 %	427727290
5	NC_019684	A	8	8	504	511	100 %	0 %	0 %	0 %	427727290
6	NC_019684	AAC	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727290
7	NC_019684	GCC	2	6	588	593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427727290
8	NC_019684	TGG	2	6	647	652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427727290
9	NC_019684	CTCAT	2	10	670	679	20 %	40 %	0 %	40 %	427727290
10	NC_019684	TGT	2	6	826	831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727290
11	NC_019684	TAG	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727290
12	NC_019684	AAG	2	6	874	879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727290
13	NC_019684	T	6	6	882	887	0 %	100 %	0 %	0 %	427727290
14	NC_019684	TACAT	2	10	899	908	40 %	40 %	0 %	20 %	427727290
15	NC_019684	AGT	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727290
16	NC_019684	CCA	2	6	945	950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427727290
17	NC_019684	A	8	8	1054	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	427727290
18	NC_019684	TGC	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727290
19	NC_019684	AGA	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727290
20	NC_019684	AC	3	6	1376	1381	50 %	0 %	0 %	50 %	427727290
21	NC_019684	GAA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727290
22	NC_019684	TGG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427727290
23	NC_019684	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	427727290
24	NC_019684	AAC	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727290
25	NC_019684	TC	3	6	1931	1936	0 %	50 %	0 %	50 %	427727291
26	NC_019684	CTA	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727291
27	NC_019684	AGG	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427727291
28	NC_019684	GAT	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727291
29	NC_019684	GTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727291
30	NC_019684	ATT	2	6	2345	2350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427727291
31	NC_019684	TGC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727291
32	NC_019684	AGC	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427727291
33	NC_019684	CAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727291
34	NC_019684	TGC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727291
35	NC_019684	A	7	7	2767	2773	100 %	0 %	0 %	0 %	427727291
36	NC_019684	AG	3	6	2853	2858	50 %	0 %	50 %	0 %	427727291
37	NC_019684	GGT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427727291
38	NC_019684	CCAAT	2	10	3033	3042	40 %	20 %	0 %	40 %	427727291
39	NC_019684	TTG	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
40	NC_019684	ACC	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427727292
41	NC_019684	TAG	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
42	NC_019684	A	6	6	3433	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	427727292
43	NC_019684	CTT	3	9	3452	3460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727292
44	NC_019684	TCT	2	6	3593	3598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727292
45	NC_019684	CTA	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727292
46	NC_019684	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
47	NC_019684	TGC	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727292
48	NC_019684	CAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727292
49	NC_019684	CGAGA	2	10	3801	3810	40 %	0 %	40 %	20 %	427727292
50	NC_019684	AGA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727292
51	NC_019684	AATC	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	427727292
52	NC_019684	TGC	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727292
53	NC_019684	CCA	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427727292
54	NC_019684	GA	4	8	4011	4018	50 %	0 %	50 %	0 %	427727292
55	NC_019684	ATAA	2	8	4024	4031	75 %	25 %	0 %	0 %	427727292
56	NC_019684	TTA	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427727292
57	NC_019684	CCA	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427727292
58	NC_019684	TTGGGT	2	12	4111	4122	0 %	50 %	50 %	0 %	427727292
59	NC_019684	TTG	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
60	NC_019684	ATG	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
61	NC_019684	TGTTT	2	10	4166	4175	0 %	80 %	20 %	0 %	427727292
62	NC_019684	TTG	2	6	4192	4197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
63	NC_019684	GCA	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427727292
64	NC_019684	TGAG	2	8	4226	4233	25 %	25 %	50 %	0 %	427727292
65	NC_019684	TAA	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427727292
66	NC_019684	A	6	6	4312	4317	100 %	0 %	0 %	0 %	427727292
67	NC_019684	GTAA	2	8	4452	4459	50 %	25 %	25 %	0 %	427727292
68	NC_019684	AGC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427727292
69	NC_019684	CAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727292
70	NC_019684	CAC	2	6	4542	4547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427727292
71	NC_019684	TGA	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
72	NC_019684	CTT	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727292
73	NC_019684	TAG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
74	NC_019684	ATA	2	6	4628	4633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427727292
75	NC_019684	TTA	2	6	4658	4663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427727292
76	NC_019684	TTGT	2	8	4677	4684	0 %	75 %	25 %	0 %	427727292
77	NC_019684	TGT	3	9	4682	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
78	NC_019684	TGT	2	6	4700	4705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
79	NC_019684	CTAG	2	8	4817	4824	25 %	25 %	25 %	25 %	427727292
80	NC_019684	TTG	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
81	NC_019684	AG	3	6	4938	4943	50 %	0 %	50 %	0 %	427727292
82	NC_019684	ATC	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727292
83	NC_019684	CA	3	6	5099	5104	50 %	0 %	0 %	50 %	427727292
84	NC_019684	GATA	2	8	5160	5167	50 %	25 %	25 %	0 %	427727292
85	NC_019684	TTG	2	6	5264	5269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727292
86	NC_019684	ACC	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427727292
87	NC_019684	GCT	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727292
88	NC_019684	GTA	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
89	NC_019684	TGAG	2	8	5429	5436	25 %	25 %	50 %	0 %	427727292
90	NC_019684	GCT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727292
91	NC_019684	TGA	2	6	5561	5566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
92	NC_019684	CAA	2	6	5577	5582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727292
93	NC_019684	TCT	2	6	5651	5656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727292
94	NC_019684	GAC	2	6	5722	5727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427727292
95	NC_019684	GGA	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427727292
96	NC_019684	TCA	2	6	5777	5782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727292
97	NC_019684	TGACC	2	10	5841	5850	20 %	20 %	20 %	40 %	427727292
98	NC_019684	ATC	2	6	5876	5881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727292
99	NC_019684	TGC	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727292
100	NC_019684	GTA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727292
101	NC_019684	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727293
102	NC_019684	TGC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727293
103	NC_019684	GCG	2	6	6483	6488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427727293
104	NC_019684	GCT	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727293
105	NC_019684	CA	3	6	6689	6694	50 %	0 %	0 %	50 %	427727293
106	NC_019684	TTC	2	6	6696	6701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727293
107	NC_019684	GAA	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727293
108	NC_019684	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727293
109	NC_019684	GAA	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727293
110	NC_019684	ACT	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727293
111	NC_019684	TAT	2	6	6944	6949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427727293
112	NC_019684	CATC	2	8	7001	7008	25 %	25 %	0 %	50 %	427727293
113	NC_019684	CGC	2	6	7108	7113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427727293
114	NC_019684	CAT	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727293
115	NC_019684	TCA	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727293
116	NC_019684	TTC	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727293
117	NC_019684	TGC	3	9	7509	7517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427727293
118	NC_019684	CGC	2	6	7535	7540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427727293
119	NC_019684	CT	3	6	7681	7686	0 %	50 %	0 %	50 %	427727294
120	NC_019684	CAA	2	6	7778	7783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727294
121	NC_019684	GTT	2	6	7930	7935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727294
122	NC_019684	TGT	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727295
123	NC_019684	AAT	2	6	8080	8085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427727295
124	NC_019684	GA	3	6	8092	8097	50 %	0 %	50 %	0 %	427727295
125	NC_019684	CCAG	2	8	8132	8139	25 %	0 %	25 %	50 %	427727295
126	NC_019684	TTG	2	6	8216	8221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727295
127	NC_019684	ATG	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727295
128	NC_019684	T	7	7	8278	8284	0 %	100 %	0 %	0 %	427727295
129	NC_019684	TGA	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727295
130	NC_019684	GAT	2	6	8399	8404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727295
131	NC_019684	CTT	2	6	8480	8485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427727296
132	NC_019684	TC	3	6	8510	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	427727296
133	NC_019684	TAA	2	6	8517	8522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427727296
134	NC_019684	AAT	2	6	8595	8600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427727296
135	NC_019684	TAG	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727296
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245	NC_019684	TGCT	2	8	15348	15355	0 %	50 %	25 %	25 %	427727302
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251	NC_019684	GAC	2	6	16766	16771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427727303
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253	NC_019684	TTTG	2	8	16966	16973	0 %	75 %	25 %	0 %	427727303
254	NC_019684	GCAA	2	8	17036	17043	50 %	0 %	25 %	25 %	427727303
255	NC_019684	CA	3	6	17115	17120	50 %	0 %	0 %	50 %	427727303
256	NC_019684	GCC	2	6	17122	17127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427727303
257	NC_019684	ACA	2	6	17174	17179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727303
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259	NC_019684	CAA	2	6	17247	17252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427727303
260	NC_019684	GGT	2	6	17256	17261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427727303
261	NC_019684	CGG	2	6	17330	17335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427727303
262	NC_019684	ATT	2	6	17480	17485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427727303
263	NC_019684	GATCGC	2	12	17505	17516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427727303
264	NC_019684	TGG	2	6	17585	17590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427727303
265	NC_019684	TCA	2	6	17626	17631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727303
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268	NC_019684	AAG	2	6	18016	18021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427727304
269	NC_019684	TTG	2	6	18066	18071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427727304
270	NC_019684	TGA	2	6	18256	18261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427727304
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272	NC_019684	A	7	7	18294	18300	100 %	0 %	0 %	0 %	427727304
273	NC_019684	GGTTG	2	10	18314	18323	0 %	40 %	60 %	0 %	427727304
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284	NC_019684	TAAAT	2	10	18708	18717	60 %	40 %	0 %	0 %	427727304
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291	NC_019684	GGA	2	6	19027	19032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427727305
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294	NC_019684	C	6	6	19152	19157	0 %	0 %	0 %	100 %	427727305
295	NC_019684	TATT	2	8	19175	19182	25 %	75 %	0 %	0 %	427727305
296	NC_019684	TATG	2	8	19193	19200	25 %	50 %	25 %	0 %	427727305
297	NC_019684	TCA	2	6	19214	19219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427727305
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299	NC_019684	CTC	2	6	19255	19260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427727305
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301	NC_019684	TTTCTA	2	12	19375	19386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	427727305
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382	NC_019684	CT	3	6	24655	24660	0 %	50 %	0 %	50 %	427727309
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